FLCL Progressive

سال‌ها از زمانی که نائوتا و هاروهارا هاروکو ماجراجویی مشترکشان را پشت سر گذاشته‌اند، می‌گذرد. در همین حال، جنگ میان دو گروه معروف به «مدیکال مِکانیکا» و «فریترنیتی» در سراسر کهکشان ادامه دارد.

در این میان، هیدومی، دختر نوجوانی است که باور دارد از زندگی معمولی و روزمره‌اش قرار نیست اتفاق خاصی نصیبش شود؛ تا اینکه روزی معلم جدیدی به نام هاروکو وارد مدرسه‌اش می‌شود.

خیلی زود، مدیکال مِکانیکا به شهر آن‌ها حمله می‌کند و هیدومی متوجه می‌شود رازی درون خودش دارد که می‌تواند همه را نجات دهد؛ رازی که تنها هاروکو می‌تواند آن را آشکار کند.

اما چرا هاروکو به زمین برگشته است؟

چه اتفاقی برای گیتار ریکن‌بَکر ۴۰۰۱ او افتاده که آن را نزد نائوتا گذاشته بود؟

و ربات انسان‌نمای «کانتی» کجا رفته است؟